温室使用移动苗床经常种植单一作物（同一种或同一科），时间一长便会产生所谓的连作障碍。连作会导致土壤理化性质变坏，土壤中营养元素失去平衡，植物根系分泌的毒素积累等，对作物造成危害。防止连作障碍的主要措施是土壤消毒和作物嫁接换根。

①土壤消毒

物理消毒法：利用太阳能在夏季温室休闲期进行土壤深翻暴晒。

化学药剂消毒:温室土壤消毒用的药剂主要有石灰氮、威百亩、棉隆福、尔马林等。

②嫁接换根

用抗病的物种或品种作佔木，以栽培品种作接穗实行嫁接育苗，可防止黄瓜枯萎病、茄子黄萎病、番茄褐色根腐病等病害。